宋应星一听，不由得大喜。皇上说得这个，就是自己喜欢做的，愿意去做的，他当即没有任何犹豫，立刻答应了下来。
崇祯皇帝见了，便微笑着招呼道：“卿这个司，乃是从头草创，要做的事情太多了。如今朕和孙卿要议的事情，也都有卿这个司要涉及的东西，因此卿也来旁听一番……”
说着话，进了大堂，宋应星跟在后面，恭敬地听着，也跟进了大堂。而他的书童，已经在院子一角呆若木鸡，直到老爷消失在视线内，他才回过神来。而后，他一个人就待在那角落，脸上的表情丰富多彩，变化多端，沉浸在想象中。
没一会功夫，孙传庭便在一名锦衣卫的引导下，来到这次议事大堂觐见皇帝。这是他来南方就任之后，第一次面圣，显得极其庄重。
边上的宋应星也有点好奇，打量着这个南方最有名的，有着“冷面阎王”之称的封疆大吏。他的第一个印象，便是干练，不苟言笑。
崇祯皇帝倒是和刚才并没有什么两样，照样是轻轻松松地样子，微笑着让孙传庭平身，又给在场的这些人做了下介绍。
孙传庭在听到科技清吏司这个新设部门时，没有表情的脸上终于露出了一丝疑惑。说起来，他也是传统的文人，一心在忙政事，对于从北向南推广过来的科学技术知识，并不是很了解。因此，他也没法第一时间就从名字上猜出什么。哪怕是崇祯皇帝稍微向他解释了之后，也是没有概念。
而后崇祯皇帝又向孙传庭介绍站在最末尾的那个中年人道：“这个，就是朕的徒弟，原来是做木匠的，徐正明！”
“……”听到这个介绍，孙传庭那脸色，变化就大了，在场的，他一直以为是什么官员，没想到，竟然闹出了个皇帝的徒弟，让他很是吃了一惊。
崇祯皇帝看他脸色，便笑着说道：“当初迷上后死皮赖脸赖上朕的，也是没办法，就只好收下。不过也算还行，没有辜负朕的期待。这一次传卿过来，就一件重要的事情，就是让卿开开眼，看看我这位徒弟做出来的东西。”
孙传庭的城府是够深地，在惊讶之后已经又恢复面无表情的神态，听到皇帝的话后也只是在心中好奇，不知道有什么东西能让皇上下旨，把自己这个浙闽粤三省暂代总督传来应天府。同时心中也在暗暗感慨，自己这个皇上，每次见面都能让自己吃上一惊。
在介绍了一轮之后，崇祯皇帝便脸色一正，开始说正题了：“现在南洋吕宋已经基本掌握在我大明手中，这等于是在南洋西夷的殖民势力中，硬生生地被大明插入了一个钉子。如果朕所料不错，南洋的西夷，包括敌视大明的其他势力，必将夜不能寐，很有可能，他们会联合起来对付我大明……”
孙传庭见说起正事，便严肃了脸，认真听着。以大明的强大，如果大明有心南下的话，确实南洋诸多势力，没有一个会是大明的对手。他们如果不愿臣服的话，就只有联合。
这么想着，他不自觉地微微点头，表示同意皇上的这个分析。
“……朕已经决定，改封益王就藩吕宋。以后吕宋就是我大明的了。不过如此一来，大明周边势力，看到大明已经连续分封三个藩王就藩国外，必定会引起他们的恐慌。就目前来说，多重因素之下，南洋诸多势力联合抵抗我大明的可能性，会大大增加。”
说到这里，崇祯皇帝看着孙传庭，忽然又转移了话题道：“让你革职留任的那些西夷，劫掠走的大明百姓，就在南洋，目前处于刘香海贼的控制之下。等把他们救回，卿便可以官复原职。”
暂代总督一职，虽然孙传庭目前的权力和以前其实一个样，但终归是名不正言不顺！皇上提出了具体的官复原职措施，孙传庭自然也是在意的，他当即回奏道：“陛下放心，臣一定派兵讨伐海贼，救回我大明百姓！”
崇祯皇帝一听，伸手摆了摆道：“孙卿且先别急，大明百姓是一定要救回的，但必须和南洋局势通盘谋划。”
宋应星在边上听了半天，心中非常惊讶，南洋那边的局势，他一点都不清楚，这是第一次听说。那是不是说，以后南洋的土产，对大明来说，也不再是夷货了？
他在想着，崇祯皇帝又在说了：“因此，朕决定，在粤地修建一处造船厂，规模要大，用于建造战船。在通州造船厂的新技术，都要应用于这个新的造船厂。朕的目标，就是要用最好的战船、大炮武装我大明水师。等过两年，朕将宣布大明新的三军，其中之一，便是海军，地位和陆军等同。“
一直以来的三军，其实是指骑马打仗的前、中、后三军。
前军一般是先锋营负责开路、侦察、应付小规模的战斗，带部分军需物资。而中军就是统帅所处的大军，有当时作战的大部分作战兵种，比如精锐骑兵和精锐步兵等等。后军主要就是全军的主要军用物资、工匠、以及大量的民工等，当然也有部分军队。
当然，另外也有一个说法，就是商鞅提出来的三军：壮男为一军，壮女为一军，男女之老弱者为一军，此之谓三军也。这种说法太小众，就不提了。
此时听到崇祯皇帝问话，在场的几个人都没听说过这个新概念，孙传庭心中明白，皇上这是要大大提高水师的地位，这个在之前已经看出一二了。不过他对皇上所提的三军，还是有点好奇地，这种事情，也要弄个明白，便向崇祯皇帝奏道：“陛下，三军不知是哪三军？”
宋应星也很好奇，竖着耳朵听着。唯独徐正明对于这种打仗什么的没兴趣，有点在开小差，又在想着他的热气球了。
崇祯皇帝听到问话，便微笑着回答道：“朕之所谓新的三军，乃是陆军，海军和空军。”